En l'àmbit territorial, la PG-ME s'estructura territorialment en 9 regions (Girona, Ponent, Pirineu Occidental, Central, Metropolitana Nord, Barcelona, Metropolitana Sud, Camp de Tarragona i Terres de l'Ebre).
Cada Regió policial és l’agrupació de diverses àrees bàsiques policials. Les àrees bàsiques policials són la unitat mínima, geogràfica i poblacional, dotada d’uns serveis bàsica per a l’atenció primària de les demandes de prevenció, seguretat ciutadana, control de trànsit i investigació de primer nivell –Llei 4/2003, de 7 d’abril, d’ordenació del sistema de seguretat pública de Catalunya).
Corresponen a les regions policials les funcions següents:
• Vetllar, en el seu territori, per l'assoliment dels objectius generals de la policia de la Generalitat-mossos d'esquadra en l'àmbit de responsabilitat de la Comissaria Superior de Coordinació Territorial.
• Exercir la direcció i el comandament de les àrees i unitats regionals i àrees bàsiques policials del seu territori.
• Gestionar i canalitzar els requeriments policials de les àrees bàsiques policials.
• Planificar, programar, coordinar, analitzar i avaluar els dispositius i operacions que depassin el territori d'una de les àrees bàsiques policials, sempre que no afectin l'àmbit territorial d'una altra regió policial.
• Exercir qualsevol altra funció de naturalesa anàloga que li encomanin.